Helsingin seurakuntayhtymän muodostavat Haagan seurakunta, Herttoniemen seurakunta, Kallion seurakunta, Kannelmäen seurakunta, Lauttasaaren seurakunta, Malmin seurakunta, entinen Meilahden seurakunta (yhdistynyt Töölön seurakuntaan), Helsingin Mikaelin seurakunta, Munkkiniemen seurakunta, Oulunkylän seurakunta, Paavalin seurakunta, Pakilan seurakunta, Pitäjänmäen seurakunta, Roihuvuoren seurakunta, Helsingin tuomiokirkkoseurakunta, Töölön seurakunta, entinen Vartiokylän seurakunta (yhdistynyt Mikaelin seurakuntaan), Vuosaaren seurakunta, Johannes församling, Matteus församling ja Petrus församling.

Hautausmaat: Hietaniemen, Honkanummen (Vantaalla), Kulosaaren, Malmin ja Östersundomin hautausmaa sekä Maunulan uurnalehto.